Отнесение сумм налога на добавленную стоимость (НДС) в зачет в ИС ЭСФ осуществляется на основании полученных ЭСФ путем формирования и обработки извещений об отнесении в зачет НДС.
Извещение об отнесении в зачет НДС является учетным документом ИС ЭСФ, содержащим сведения о суммах оборота и НДС, принимаемых либо не принимаемых налогоплательщиком к зачету за соответствующий отчетный период.
Формирование извещений об отнесении в зачет НДС возможно следующими способами:
- вручную пользователями на веб-портале ИС ЭСФ;
- путем импорта извещений из файлов формата Excel и XML;
- посредством интеграции учетных систем налогоплательщиков с ИС ЭСФ через API.
Подтвержденные (подписанные электронной цифровой подписью и успешно обработанные) извещения об отнесении в зачет НДС не подлежат редактированию. Внесение изменений в ранее подтвержденные сведения осуществляется путем формирования новых извещений в соответствии с правилами, установленными функционалом ИС ЭСФ.
Необходимые полномочия пользователей
Для работы с функционалом «Отнесение в зачет НДС» пользователи ИС ЭСФ должны обладать соответствующими полномочиями.
Для работы с платежными поручениями в меню «Регистрационный учет» — «Управление персоналом» руководитель компании должен назначит необходимые полномочия своим сотрудникам и подписать электронную доверенность ЭЦП.

Перечень доступных полномочий и их описание представлено в таблице ниже.
| № п\п | Наименование полномочия | Описание полномочия | Доступно для следующих типов/ролей пользователей |
| Полномочия пользователей — налогоплательщиков | |||
| 1 | Создание извещение об отнесении в зачет НДС | Предоставляет доступ к следующим функциям: просмотр журнала «Отнесение в зачет НДС»;выгрузка данных из журнала «Отнесение в зачет НДС»;создание нового извещения;редактирование черновика извещения;создание копии извещения;импорт строк извещения из excel и xml-файла; удаление извещений в статусе «Черновик», «Импортирован», «Ошибочный»;подписание извещения ЭЦП;загрузка подписанных извещений из учетных систем. | Руководитель ЮЛ, ИП, сотрудники ЮЛ, ИП |
| 2 | Создание черновика извещения об отнесении в зачет НДС | Предоставляет доступ к следующим функциям: просмотр журнала «Отнесение в зачет НДС»;выгрузка данных из журнала «Отнесение в зачет НДС»;удаление извещений в статусе «Черновик», «Импортирован», «Ошибочный»;создание нового извещения;редактирование черновика извещения;создание копии извещения;импорт строк извещения из excel и xml-файла. | Руководитель ЮЛ, ИП, сотрудники ЮЛ, ИП |
| 3 | Просмотр сведений об отнесении в зачет НДС | Предоставляет доступ к следующим функциям: просмотр журнала «Отнесение в зачет НДС»;выгрузка данных из журнала «Отнесение в зачет НДС». | Руководитель ЮЛ, ИП, сотрудники ЮЛ, ИП |
